国的“享禄错乱”便以小一揆方加贺三寺的完败划上了句号。
而本愿寺证如为了加速恢复北陆道一向宗的实力，并防止效仿本泉寺莲悟、松冈寺莲纲之人的出现，将发动“享禄错乱”的罪名加诸于立下首功的下间赖秀、下间赖盛二人身上，指责两人为了个人的野心杀害净土真宗门徒的野心家，将两人处以死刑。还真可谓是“飞鸟尽，良弓藏”。
到了此时，原加贺一向宗的权力上层荡然无存，再也没有什麽能阻止本愿寺法主君临加贺国了。一方面，证如将近畿本愿寺体制移植到加贺，使加贺国成为了彻底的本愿寺领国。另一方面，又以“大小一揆本同是净土真宗弟子”为号召，收回了对中下级小一揆门徒的“破门状”，感激落泪的小一揆门徒们在走投无路之际重获光明，纷纷返回加贺，向本愿寺证如表明忠诚。
之后十年，朝仓家与加贺一向一揆之间几乎年年都有大小规模不等的交锋，可是双方谁都奈何不了谁。